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大連化物所復(fù)雜體系酶與底物相互作用的酶促動(dòng)力學(xué)研究獲進(jìn)展

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大連化物所復(fù)雜體系酶與底物相互作用的酶促動(dòng)力學(xué)研究獲進(jìn)展

摘要:   近日,中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理學(xué)習(xí)所生物分離分析新材料與新技術(shù)學(xué)習(xí)組在復(fù)雜體系酶與底物相互作用的酶促動(dòng)力學(xué)學(xué)習(xí)方面取得新進(jìn)展。該工作在原有工作(Nature Methods,2014,11,220-222)的基礎(chǔ)上,建立了復(fù) ...

  近日,中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理學(xué)習(xí)所生物分離分析新材料與新技術(shù)學(xué)習(xí)組在復(fù)雜體系酶與底物相互作用的酶促動(dòng)力學(xué)學(xué)習(xí)方面取得新進(jìn)展。該工作在原有工作(Nature Methods,2014,11,220-222)的基礎(chǔ)上,建立了復(fù)雜酶促體系酶促動(dòng)力學(xué)的理論模型,發(fā)現(xiàn)在一定條件下可以用準(zhǔn)一級(jí)動(dòng)力學(xué)方程描述每個(gè)底物的反應(yīng),實(shí)現(xiàn)了底物催化效率的通量化測(cè)定,相關(guān)學(xué)習(xí)成果發(fā)表在分子與細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)(Molecular  Cellular Proteomics,DOI:10.1074/mcp.M116.062869)上。
  酶,支配著生物體內(nèi)的新陳代謝、能量轉(zhuǎn)換等許多催化過(guò)程。人類的疾病,大多數(shù)與體內(nèi)酶的活性異常有關(guān),底物篩選作為酶特異性以及藥物開(kāi)發(fā)的學(xué)習(xí)基礎(chǔ)已成為一大學(xué)習(xí)熱點(diǎn)。底物催化效率常數(shù)的大小與復(fù)雜體系中酶作用在不同底物的相對(duì)反應(yīng)速率呈正相關(guān),因而可為酶底物篩選提供量化的理論依據(jù)。然而,傳統(tǒng)方法在計(jì)算底物的催化效率時(shí),需要將不同濃度的單一底物分別與酶作用,大大限制了常數(shù)計(jì)算的通量。該學(xué)習(xí)組此次將傳統(tǒng)的米氏方程進(jìn)行衍生化處理,并應(yīng)用于多種競(jìng)爭(zhēng)酶底物同時(shí)存在的復(fù)雜反應(yīng)體系中,發(fā)現(xiàn)當(dāng)反應(yīng)體系滿足條件

  時(shí),各個(gè)底物之間的相互競(jìng)爭(zhēng)可以忽略不計(jì),即在這種情況下可以簡(jiǎn)單通過(guò)準(zhǔn)一級(jí)動(dòng)力學(xué)方程直接進(jìn)行底物催化效率的準(zhǔn)確計(jì)算。將這種方法與質(zhì)譜技術(shù)相結(jié)合,實(shí)現(xiàn)在一次實(shí)驗(yàn)中成功鑒定到2369個(gè)蛋白酶底物并準(zhǔn)確得到相應(yīng)的催化效率常數(shù)。
  酶底物的定量化精準(zhǔn)篩選可以為酶抑制劑和相應(yīng)藥物的設(shè)計(jì)研發(fā)提供更詳細(xì)的信息。該工作提出并驗(yàn)證了基于米氏方程的新動(dòng)力學(xué)模型,將對(duì)復(fù)雜體系中酶與底物間的相互作用學(xué)習(xí)起到促進(jìn)作用。
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  大連化物所復(fù)雜體系酶與底物相互作用的酶促動(dòng)力學(xué)學(xué)習(xí)獲進(jìn)展
  來(lái)源:大連化學(xué)物理學(xué)習(xí)所  編輯:葉瑞優(yōu)大連化物所復(fù)雜體系酶與底物相互作用的酶促動(dòng)力學(xué)研究獲進(jìn)展  |  責(zé)任編輯:曉木蟲
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