摘要: 5月8日，國際期刊分子生物學(xué)與進(jìn)化（Molecular Biology and Evolution）在線發(fā)表了中國科學(xué)院動(dòng)物學(xué)習(xí)所張健旭學(xué)習(xí)組與北京生命科學(xué)學(xué)習(xí)院孫中生、趙方慶兩個(gè)學(xué)習(xí)組合作，對(duì)我國褐家鼠及姊妹種——大足鼠的基因 ...
5月8日，國際期刊分子生物學(xué)與進(jìn)化（Molecular Biology and Evolution）在線發(fā)表了中國科學(xué)院動(dòng)物學(xué)習(xí)所張健旭學(xué)習(xí)組與北京生命科學(xué)學(xué)習(xí)院孫中生、趙方慶兩個(gè)學(xué)習(xí)組合作，對(duì)我國褐家鼠及姊妹種——大足鼠的基因組比較學(xué)習(xí)的成果（滕花景/張瑤華/石承民等，Population genomics reveals speciation and introgression between Brown Norway rats and their sibling species）。 褐家鼠屬于家棲性鼠類，生態(tài)適應(yīng)性極強(qiáng)，分布幾乎遍布全球，是地球上最為成功的入侵哺乳動(dòng)物。由其馴化而來的實(shí)驗(yàn)室大鼠成為最早的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物，已被廣泛地應(yīng)用于生命科學(xué)學(xué)習(xí)，它也是全球危害最為普遍的鼠。我國東北地區(qū)和蒙古被認(rèn)為是褐家鼠的重要起源地。張健旭/張瑤華前期與英國科學(xué)家Peter Keightley合作，發(fā)現(xiàn)我國東北地區(qū)的褐家鼠種群遺傳多樣性很低，僅僅是小家鼠的五分之一，大約在2萬年前出現(xiàn)過一個(gè)種群瓶頸（2012 G3. 2:1661-1664；2015 Mol. Biol. Evol. 32，2547-2558）。與小家鼠相比較，褐家鼠的野外生物學(xué)學(xué)習(xí)要少得多，它作為獨(dú)立物種出現(xiàn)的時(shí)間以及能迅速適應(yīng)環(huán)境的基因組特點(diǎn)更是知之甚少。 針對(duì)我國遺傳多樣性豐富的褐家鼠資源，學(xué)習(xí)人員進(jìn)一步利用比較基因組學(xué)，對(duì)我國多個(gè)褐家鼠種群及其姊妹種大足鼠的群體進(jìn)行了全基因組測(cè)序和比較，發(fā)現(xiàn)廣布性褐家鼠的核苷酸多樣性反而比狹布性大足鼠的低，褐家鼠的有效種群大小隨歷史波動(dòng)比較大，在末次冰期存在一個(gè)遺傳瓶頸，兩個(gè)姊妹種的分化時(shí)間與東亞發(fā)生的最大一次冰川的時(shí)間是吻合的，據(jù)此推斷劇烈的氣候變化影響了褐家鼠的物種形成。 他們還發(fā)現(xiàn)分化后的兩個(gè)姊妹種仍然發(fā)生過種間的雜交，通過種間交流保留下來的與化學(xué)通訊相關(guān)的一些基因組區(qū)間以及褐家鼠基因組上受到選擇性清除的與食物代謝、免疫反應(yīng)、警覺和焦慮相關(guān)的區(qū)間在褐家鼠生態(tài)適應(yīng)中可能發(fā)揮了重要作用。 這項(xiàng)學(xué)習(xí)闡明了褐家鼠物種的成種時(shí)間，揭示了分化后的褐家鼠與其姊妹種的種群歷史變化及種間雜交，為闡明物種適應(yīng)性分化提供了重要例證，為揭示褐家鼠這一廣布種生態(tài)適應(yīng)的分子基礎(chǔ)提供了重要證據(jù)。 中科院動(dòng)物所博士學(xué)習(xí)生滕花景、助理學(xué)習(xí)員張瑤華和石承民為共同第一作者，學(xué)習(xí)得到了中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)和國家自然科學(xué)基金委等項(xiàng)目的資助。
